طبق ماده 13 آیین‌نامه اجرائی موضوع تبصره 3 ماده 169 قانون مالیات‌های مستقیم، موارد زیر مشمول ارسال فهرست معاملات نمی باشند:
- خرید و فروش و سود و کارمزد اوراق بهادار
- خرید و فروش سهام و سهم‌الشرکه و حق تقدم سهام یا سهم‌الشرکه
- سود و کارمزد و جریمه‌های بانک‌ها، صندوق تعاون، صندوق‌های حمایت از توسعه بخش کشاورزی، موسسات اعتباری غیربانکی مجاز و صندوق‌های قرض‌الحسنه
- سود سهام و سهم‌الشرکه
- حق عضویت اعضاء مجامع حرف‌ها، احزاب و انجمن‌ها و تشکل‌های غیردولتی دارای مجوز از مراجع ذی‌صلاح
- کمک‌ها، جوایز و هدایای بلاعوض
- مبالغی که تحت عناوین جریمه یا خسارت، انواع عوارض و مالیات (به استثناء مالیات و عوارض قانون مالیات بر ارزش افزوده)، حق ثبت، حق تمبر، حقوق گمرکی و موارد مشابه، به دستگاه‌های اجرائی پرداخت می‌گردد.
- حقوق و دستمزد پرداختی موضوع فصل سوم از باب سوم قانون مالیات‌های مستقیم
- وجوه پرداختی بابت حق نگهداری (شارژ) ساختمان محل فعالیت و آبونمان‌های پرداختی
- صورتحساب‌های الکترونیکی ثبت شده در کارپوشه فروشنده حقیقی یا حقوقی در سامانه مودیان
- صورتحساب‌های الکترونیکی ثبت شده در کارپوشه خریدار حقیقی یا حقوقی که خریدار نسبت به عدم پذیرش آن مطابق تبصره بند (ب) ماده (5) قانون پایانه‌های فروشگاهی و سامانه مودیان اقدام نکرده است.
- قراردادهای ثبت شده در کارپوشه فروشنده و خریدار حقیقی یا حقوقی در سامانه مودیان
- اطلاعات مربوط به واردات که در اجرای تبصره ماد 5 قانون پایانه‌های فروشگاهی و سامانه مودیان به سامانه مودیان منتقل شده است.
چهار مورد آخر طی بخشنامه شماره 210/10556/د مورخ 1403/02/23 به انتهای ماده 13 آیین‌نامه اجرایی موضوع تبصره 3 ماده 169 قانون مالیات‌های مستقیم اضافه گردید.